Het is 1944 en Londen siddert onder de aanhoudende bombardementen van nazi-Duitsland. De veertienjarige wees Charlie Matters steelt wat nodig is om te overleven. Zodra hij oud genoeg is, wil hij gaan vechten tegen de Duitsers. De vijftienjarige Molly Wakefield is intussen na vijf jaar relatieve veiligheid op het platteland teruggekeerd naar Londen. Maar in plaats van een feestelijke thuiskomst, wacht haar het bericht dat haar vader en moeder zijn verdwenen.

Charlie en Molly raken met elkaar bevriend, en met Ignatius Oliver, de eigenaar van boekwinkel The Book Keep. Terwijl de stad om hen heen brandt, leren de drie dat hun samenzijn en het vertrouwen in elkaar misschien wel de enige manier is om te overleven.